庆阳市中医医院于1979年在原解放军林建二师职工医院和原庆阳地区第三人民医院的基础上正式建院。1996年创建成全国地（市）级示范中医医院；2012年整体搬迁至现址（庆阳市西峰区古象路10号），占地面积50亩，建筑面积4.5万平方米。2012年被国家中医药管理局评定命名为三级甲等中医医院。设置床位900张；现有职工785人，其中正式职工456人，聘用人员315人，退休返聘人员14人，专业技术人员690人，占88%，高级职称54人。有国家优秀中医临床人才1人，甘肃中医学院研究生导师1人，甘肃省优秀专家1人，省级名中医4人，市级名中医7人。

庆阳市中医医院是一所三级甲等中医综合医院，是甘肃中医学院、陕西中医学院、宁夏医科大学和陇东学院岐伯医学院等高等院校的附属医院及教学医院。