广州市儿童医院前身为达·保罗医院。经过50多年的发展，该院已成为国内较有影响的儿童医院之一，是一所集预防、医疗、保健、康复于一体，临床、教学、科研并重的儿童专科三级甲等医院。 该院1994年建立广州市儿科研究所，1997年被评为广东省高等院校第一批入选教学基地，1998年定为广州医学院附属儿童医院。1996年该院新生儿专业被选为广东省"五个一"工程项目。广州市重症儿童救治中心于1998年成立，并被评为广州市"21世纪优先工程项目"，2003年被评为广州市重点学科、广东省特色专业。

该院住院部有400张床位，设感染、消化、呼吸、肾病、血液、神经康复、心血管、内分泌、新生儿内科、新生儿外科、泌尿外科、骨科、新生儿外科、烧伤、小儿普外、心胸外科、口腔外科、耳鼻咽喉科、眼科等病区。2005年出院病人2.1万余人次。

广州市儿童医院的特色专业也得到长足的发展，消化专业的小儿胃镜、呼吸专业的纤维支气管镜、儿外科的腹腔镜使用技术日趋成熟。内分泌专业加强了内分泌实验室的建设；肾脏专业的血液透析，血液灌流、血液滤过、血液净化等治疗技术在抢救危重病人中发挥了一定作用；耳鼻喉专业的小儿耳鼻喉内窥镜检查、小儿听力检测和评估、小儿睡眠呼吸障碍综合症的诊断及治疗在华南地区乃至全国处于领先水平。眼科开展了社区儿童眼保健工作，推动了广州市儿童眼保健事业的发展。