巨野县人民医院始建于1949年，历经六十多年的发展，现已成为一所融集医疗、教学、科研、预防、保健、康复、急诊急救服务为一体的大型现代化的综合性二级甲等医院。

截止2013年底，医院占地面积100亩，医疗区面积64000平方米，设有临床、医技、药剂、行政、后勤70余个科室，40余个专业，25个病区，编制床位500张，开放床位760张。现有在职职工1169人，其中卫生专业技术人员975人，在卫生专业技术人员中市级专业技术拔尖人才3人、高级职称69人、中级职称347人

2013年，在菏泽市二甲综合医院现场评审中取得第一名。医院门诊量达25.7万人次，比2012年同期增长6.2%，出院病人32047人次，同比增长5.75%，住院手术8746例，比2012年同期增长10.0%，业务总收入2.76亿元，同比增长12.6%。

巨野县人民医院先后与北京大学人民医院、山东大学齐鲁医院、济宁医学院附属医院等建立了密切技术协作关系，现为泰山医学院临床学院、菏泽医学专科学校教学医院、菏泽卫生学校教学医院、国家级爱婴医院、菏泽市艾滋病治疗定点医院，同时也是交通事故定点医疗机构、离休干部医疗保险定点医疗机构、城镇职工医疗保险定点医疗机构、城镇居民医疗保险定点医疗机构和新型农村合作医疗定点医疗机构。