南康区中医院建院1988年，原用名县中医院，1995年改称市中医院。1996年兴建一栋2231平方米门诊综合大楼,同年,被卫生部授予“爱婴医院“称号。1997年4月,被国家中医管理局评为“二级甲等医院”。1999年3月和7月,市中医院南门分院、市中医院北门分院相续挂牌开业。

2000年，通过省“中西医结合急症治疗中心”、“江西省示范中医院”达标验收。医院占地15154平方米,建筑面积9146平方米,业务用房8684平方米。职工总数达188人,卫技人员146人,其中高级职称8人,中级职称25人,初级职称109人。有西医师37人,中医师30人,护理49人,药剂14人,医技13人。病床100张。职能科室有行政办公室、工会、护理部、宣教科、药剂科、纠风办公室、对外办公室、质控办、财务科、总务科、预防保健科。

业务科室有:中西医急诊科、内科、外科、儿科、骨伤科、妇产科、五官科、口腔科、肝病科、推拿针灸科、肛肠科、皮肤科、性病科、男性科、颈肩腰腿痛治疗中心。医技科有检查、放射、CT室、碎石、B超等。2000年门诊人次147515人,住院2741人,治愈率94%,病死率1.77%,病床使用率55%业务收入1000万元。